متابولیسم سلولی و همچنین افزایش کیفیت مورد نیاز برای کشاورزی بسیار مهم است. در این راه مصرف آمینو اسیدها در کشاورزی حائز اهمیت هستند .اگر منبعی از آمینواسیدهای گیاهی در اختیار گیاهان قرار بگیرد باعث رشد سریع ترو تکثیر سلولی بیشتر و شرایط بهتر برای فرایند فتوسنتز ایجاد می کند. در این بین جذب آمینواسیدها می تواند از روزنه های گیاهی به صورت محلول پاشی بسیار مناسب باشد. به خصوص زمانی که دمای محیط اطراف گیاه نیز مناسب به نظر برسد. برخی از مهمترین تاثیرات آمینو اسید ها بر گیاهان عبارتند از: سنتز پروتئین، افزایش مقاومت گیاهان در برابر استرس های محیطی، تاثیر بر فتوسنتز گیاهی، فعال سازی روزنه های گیاهی، کلات کردن عناصر، نقش موثر بر هورمون های گیاهی، تاثیر بر گرده افشانی و شکل گیری میوه ها، ایجاد تعادل بین گیاه و محیط زیست و تنظیم وضعیت عمومی گیاه.
یک سلول زنده از پروتئین درست شده است. پروتئین ها هم از اسیدهای آمینه تشکیل شده اند. گیاهان اسیدهای امینه را با جذب مواد کربنی از هوا و نیتروژن از خاک ایجاد می کنند. نیاز گیاهان به مقدار مشخصی از اسیدهای آمینه در افزایش تولید و بهبود کلی کیفیت کاملا مشخص شده است.
1.سنتز پروتئین: تمامی عملکردهای گیاه تحت کنترل پروتئین ها یا آنزیمها است. این پروتئینها از 20 نوع اسید آمینه سنتز شده است. استفاده از اسید آمینه در کشاورزی باعث تولید سریع پروتئین ها، افزایش مقاومت و ایمنی گیاه، ذخیره شدن انرژی در گیاه و افزایش کمی و کیفی تولید می شود.
2.مقاومت در برابر تنشها: تنش دمای بالا، رطوبت کم، یخ زدگی، حمله آفات و …اثرات منفی در متابولیسم گیاهان دارد و سبب کاهش کمی و کیفی محصول می شود. استفاده از اسیدهای آمینه قبل، در حین تنش یا بعد از آن باعث مقابله با تنش و بازیابی گیاه می شود. برای نمونه اسیدهای آمینه پرولین و هیدروکسی پرولین سبب افزایش غلظت شیرابه سلولی و مقاومت گیاه در مقابل تنشهای اسمزی مثل شوری، خشکی و بخصوص سرما و یخ زدگی می شود. اسید آمینه گلوتامات هم در تنشها به GABA (گاما آمینو بوتریک اسید) تبدیل می شود که در تنظیم pH سلول نقش مهمی دارد.
3.فتوسنتز و تولید انرژی: تولید گیاه به طور مستقیم به فتوسنتز مرتبط است. کاهش فتوسنتز به هر دلیل سبب کاهش تولید گیاه می شود. دو اسید آمینه گلایسین و گلوتامیک اسید به طور مستقیم در ساخت کلروفیل گیاه نقش اصلی ومهمی را ایفامی کند. بنابراین تغذیه مناسب گیاه با اسیدهای آمینه سبب سبزتر شدن آن می شود.
4.روزنه: روزنه های برگ محل ورود و خروج گازهای محیط، کنترل آب و جذب بعضی از مواد غذایی است. کنترل روزنه هم توسط عوامل بیرونی (مثل نور، رطوبت، دما و شوری) و درونی (غلظت اسیدهای آمینه و ابسیزیک اسید) انجام می گردد. اسید آمینه گلوتامیک اسید که یک عامل اسمزی برای سلولهای نگهبان روزنه است سبب باز شدن و باز نگهداشتن روزنه ها می گردد.
5.عامل کلاته کننده: دو اسیدآمینه گلایسین و گلوتامیک اسید سبب کلاته کردن عناصر میکرو می شوند. به عبارت ساده تر این دو اسید آمینه به عناصر غذایی مثل آهن، مس، منیزیم، روی و … متصل شده و آنها را از تخریب یا اکسید شدن حفظ کرده و همچنین سبب جذب و انتقال سریعتر و بهتر این عناصر از غشاء سلول می شوند.
6.هورمونهای گیاهی:اسیدهای آمینه پیش ساز بسیاری از ترکیبات مهم از جمله هورمونهای گیاهی و مواد رشد هستند. متیونین که یک اسید آمینه کلیدی در چرخه تولید اتیلن و تنظیم آن است عامل بیوسنتز دو ترکیب پلی آمینی اسپرمین و اسپرمیدین است. این دو ترکیب پلی آمینی طبیعی و شبه هورمونی سبب مقاومت گیاه به طیف گسترده ای از تنشهای محیطی می شوند. اسید آمینه تریپتوفان سبب سنتز هورمون اکسین شده که هورمون اصلی رشد و نمو است. اسید آمینه آرژنین هم سبب تولید هورمونهای مرتبط به گل و میوه می گردد. یکی از این هورمونها پلی آمینها هستند که نقش محافظتی و تقویتی برای گیاه دارند.
7.گرده افشانی و تولید میوه: اسید آمینه پرولین به گرده گل در باروری گیاه کمک می کند. اسیدهای آمینه لایزین، متیونین گلوتامیک اسید هم از اسیدهای آمینه مهم برای گرده افشانی می باشند. این اسیدهای آمینه جوانه زنی گرده و همچنین رشد دانه گرده را بیشتر میکنند.
تنظیم فلور میکروبی خاک: گیاهان بسیاری از مواد مورد نیاز باکتری ها و قارچها را تامین میکنند. برای نمونه، متیونین یک اسید آمینه است که پیش ساز عوامل رشد دیواره میکروبهای خاکزی است. استفاده از گوگرد پودری یا اسید سولفوریک سبب از بین رفتن این میکروبها می شود. ولی استفاده از اسیدهای آمینه سبب حفظ فلور میکروبی مفید خاک می شوند.